Grande parte dos problemas em ETAR podem ser controlados com medidas que minimizem a sua origem no sistema de drenagem. Assim, alguns locais nas redes de drenagem requerem especial atenção, como por exemplo as estações elevatórias.
A bio-augmentação consiste num incremento de bactérias seleccionadas que irão ajudar naturalmente o processo biológico da degradação dos compostos orgânicos.
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